λ噬菌体基因组DNA提取试剂盒

λ噬菌体基因组DNA提取试剂盒

价格:1,500

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产品信息:

 

产品名

产品编

规格

λ噬菌体基因组DNA提取试剂盒

HRQ0560

50T

 

产品简介:

 

    λ噬菌体载体广泛用于文库筛选,目的克隆培养获得大量的噬菌体颗粒需要提取λ噬菌体DNA来开展测序等后续工作。λ噬菌体裂解培养物离心后的上清,首先用RNase A /DNase I混合酶消化去除残留的宿主菌DNA/RNA,沉淀收集噬菌体,噬菌体被SDS裂解,残留碎片通过沉淀离心去除掉。裂解物上清中的λ噬菌体DNA在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜,再通过一系列快速的漂洗-离心的步骤,将盐、细胞代谢物、蛋白等杂质去除,最后低盐的洗脱缓冲液将λ噬菌体DNA从硅基质膜上洗脱。

 

储存事项:

 

1)本试剂盒在室温储存 12 个月不影响使用效果。

2)试剂盒储存于低温(4℃或者-20℃)会造成溶液沉淀,影响使用效果,因此运输和储存均在室温下(15℃-25℃)进行。

3)避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、PH 值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。

 

产品特点:

 

1.不使用有毒的苯酚等试剂。

2.简捷,单个样品操作一般可在90分钟内完成。

3.典型的产量 10ml λ噬菌体裂解培养物上清可以提取约 10µg λ噬菌体DNA。

4.多次柱漂洗确保高纯度,OD260/OD280 典型的比值高达 1.7~1.9,可直接用于测序和酶切反应等。

 

产品组分:

 

组分

存储

50T

平衡液

室温

5ml

RNase A

-20℃

20mg

DNase I

-20℃

50mg

噬菌体沉淀液

室温

100ml

裂解缓冲液

室温

30ml

杂质沉淀液

室温

5ml

结合液LB

室温

20ml

漂洗液WB

室温

13ml

第一次使用前请添加52mL无水乙醇

洗脱缓冲液EB

室温

10mL

吸附柱AC

室温

50个

收集管

室温

50个

 

使用前必读:

1、使用转速可以达到13, 000rpm的冷冻离心机

2、开始实验前将需要的水浴先预热到37℃备用。

3、需要自备氯仿 , 20%SDS。

4、在 RNase A 管和 DNase I 管分别加入 1 毫升的裂解缓冲液吹打 ,颠倒混匀 ,充分溶解 RNase A 和 DNase I 后 , 按照每次使用量分装-20℃冻存 ,有效期 6 个月。

使用方法:

 以10mL噬菌体感染细菌培养上清提取举例:

提示:

→第一次使用前请先在在 漂洗液WB中添加指定量的无水乙醇,并做好标记!

→将噬菌体沉淀液放在冰上预冷。

1、将0.5%氯仿处理后的λ噬菌体感染的液体培养物 10,000g(约 12,000rpm) 4℃离心10 分钟去除细胞碎片和残渣。

转速不能过高,时间不能过长,否则噬菌体可能和碎片一起沉淀,降低产量。

2、取10ml 上清,加入 20μl RNase 和 20μl DNase 充分混匀 37℃温育 30 分钟。

每个噬菌体培养上清因生长和裂解情况不同而残留RNA/DNA量不等。RNase/DNase消化过头,可能减少产量;消化不完全,可能未消化的DNA/RNA和细胞碎片粘去部分噬菌体减低产量并/或者导致最后污染宿主菌DNA,因此应该根据实际情况适当调节用量和消化时间。

3、加入2 ml 冰预冷的噬菌体沉淀液,轻柔充分混匀后置冰上冷却(培养板裂解物必须在冰上放置 30 分钟)。

4、10,000g(12,000rpm)4℃离心 10 分钟,弃上清,干燥 1 分钟。沉淀下来的噬菌体外观为透亮或者稍白的沉淀。

5 、加入500μl 裂解缓冲液,吹打重悬噬菌体,加入 100μl 20%SDS,立即轻柔颠倒混匀4-6 次后,70℃温育 10 分钟,然后置冰上冷却。

6 、加入100μl 杂质沉淀液,立即轻柔颠倒混匀 4-6 次,最高速 13,000g 4℃离心 10分钟。

7、柱平衡:向吸附柱AC中加入100 µl平衡液,13, 000 rpm 离心1 min,弃滤液,备用。

平衡液可以增强硅胶膜的吸附核酸能力,请使用当天处理的吸附柱。

8 、仔细将上清转入新的离心管 ,加入 350μ l 结合液 LB ,轻柔涡旋混匀。

9、将上述混合物加入一个吸附柱 AC 中 ,(吸附柱放入收集管中) 13,000rpm 离心 30 秒 ,倒掉收集管中的废液。

 吸附柱一次最多只可以容纳大约700μl混合物,因此需要分次把混合物上到吸附柱内,重复步骤8。

10、加入 600μ l 漂洗液 WB(请先检查是否已加入无水乙醇!) , 13,000rpm 离心 15 秒 ,弃废液。

11 、 可选步骤 :重复步骤 10 一遍。

12、将吸附柱 AC 放回空收集管中 , 13,000rpm 离心 2 分钟 ,尽量除去漂洗液 , 以免漂洗液中残留乙醇抑制下游反应

13、取出吸附柱 AC ,放入一个干净的离心管中 ,在吸附膜的中间部位加 100μ l 洗脱缓冲液 EB(洗脱缓冲液事先在 50℃水浴中预热) , 室温放置 1 分钟 , 13,000rpm 离心 1 分钟。如果想得到较多量的 DNA ,可将得到的溶液重新加入离心吸附柱中 , 13,000rpm 离心 1 分钟。

洗脱体积越大 ,洗脱效率越高 ,如果需要 DNA 浓度较高 ,可以适当减少洗脱体积 ,但是最小体积不应少于 40μ l ,体积过小降低 DNA 洗脱效率 ,减少 DNA 产量

14、 DNA 可以存放在 2-8℃ ,  如果要长时间存放 ,可以放置在-20℃

常见问题和解决方法

 

常见问题 建议和解决方法
低核酸产量或者纯度不高

* 试剂盒储存在非最佳条件-建议:收到试剂盒后总是存放在室温(15℃-20℃)。* 缓冲液或者试剂暴露于减少它们有效性的条件下-建议:储存在室温(15℃-20℃),每次用完后立刻盖紧盖子,以免溶液蒸发,pH 改变和污染。

漂洗液 WB 中忘记加无水乙醇-建议:第一次实验时,在漂洗液 WB中加入指定量无水乙醇。

* 试剂和样品没有充分混匀-建议:加入每个试剂后都要充分混匀。

* 噬菌体上清滴度太低-建议:1.确认λ噬菌体已经完全裂解了宿主菌(加入 0.5%的氯仿可以帮助完全裂解);2.离心去除宿主菌碎片残渣时间不能超过 10 分钟,转速不超过 10,000g,否则否则噬菌体也可能和碎片一起沉淀丢失;3.重新培养一次噬菌体感染细菌。

* DNase I/RNase 消化不足或者过头-建议:消化过头,可能减少产量并导致最后污染宿主菌 DNA;消化不完全,可能未消化的 DNA,RNA和细胞碎片粘去部分噬菌体,因此可以适当调节用量。

宿主菌基因组DNA残留过高 DNase I/RNase 失活或者反应条件不佳-建议:DNase I/RNase 必须溶解在裂解缓冲液中,必须分装冻存。λ噬菌体必须用 LM(含镁离子)培养,在其它培养肉汤中,DNase 消化活性可能受到影响。
加入噬菌体沉淀剂后未见到λ噬菌体沉淀

* 不适合的离心温度和离心力。建议:10,000g(12,000rpm)4℃离心10 分钟。

* 上清中含λ噬菌体太少-建议:离心前,样品置冰上冷却。参见前面滴度太低解决办法

DNA 下游酶切不能切开或者酶切不完全

*忘记做步骤 12,乙醇抑制了酶切反应-建议:做步骤 12,然后空气中晾几分钟,让残留乙醇挥发。

*一些硅基质膜成分一起洗脱下来,抑制了酶切反应-建议:将洗脱的基因组 DNA 溶液 13,000rpm 再离心一分钟,小心取上清使用。

*使用了错误的培养基培养λ噬菌体-建议:λ噬菌体必须用 LM(含镁离子)培养,在其它培养肉汤中,DNA 酶切活性可能受到影响。培养板培养必须用琼脂糖 Agarose 板,如果用琼脂 Agar 板,可能抑制酶切。

纯化的 DNA产物D260数值异常偏高 一些硅基质膜成分一起洗脱下来,干扰了分光光度计读数-建议:将洗脱的回收 DNA 溶液 13,000rpm 再离心一分钟,小心取上清使用。
 

 

产品仅用于科研等非医疗用途!

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